В снегах на высокогорьях Тянь-Шаня и в горно-долинных ледниках Памира берут свое начало великие реки Туркестана - Амударья и Сырдарья. Вырвавшись из горных теснин на Туранскую равнину, они поят живительной влагой оазисы, крутят турбины ГЭС, орошают поля, раскинувшиеся на бескрайних просторах песчаных пустынь Каракумы и Кызылкум. За последние 30 лет в результате бесконтрольного использования речной воды обмелел Арал, обнажились когда-то благодатные места для нереста рыбы, занесены песком многочисленные острова, на прибрежной полосе которых гнездились большие колонии озерных птиц. Из-за повышенной концентрации солей в море погибло все живое. Начиная с 1982 года на Арале полностью прекратился лов рыбы и это там, где ее добывалось более 400 тысяч центнеров в год. Из-за безводья в низовьях Амударьи и Сырдарьи высохли многие озера, где кроме рыбы в отдельные годы отлавливалось 2 миллиона ондатр. Необдуманными действиями человек разрушил сложившуюся веками благополучную экологическую обстановку. Из-за большой фильтрации воды в стенках земляных каналов, завышения норм поливов хлопчатника и сброса излишков воды в безжизненных пустынях Кызылкум и Каракум образовались тысячи больших и малых озер. Из них гигантскими размерами выделяются оз. Айдар-куль, вытянувшееся почти на 200 км (объем 16 млрд.м.куб), и Сарыкамыш, в котором сосредоточено более 20 млрд.м.куб воды. Вновь образовавшиеся озера-гиганты стали своеобразными резерватами для размножения многих видов рыб и птиц. С островов и песчаных кос, оглашая водные просторы, далеко несется трубный рев пеликанов, белыми облаками плавают лебеди-шипуны, серые гуси. На низкорослой туранге и просто на земле строят свои гнезда-башенки большие и малые бакланы. По соседству с ними гнездятся чегравы, морские голубки, озерные и серебристые чайки-хохотуньи, кулики-ходулочники, шилоклювки, тиркушки.

В летний паводок широко и привольно катят свои воды Амударья и Сырдарья. В стремительных водах Амударьи, реки с каменистым дном, держатся большой и малый лопатоносы, в тихих заводях плещутся сазаны, судак, усач, сомы, достигающие порой 100-150 кг. В прибрежных тугайных зарослях рек гнездится местная "жарптица" - фазан, а также кваквы, серые и рыжие цапли и множество насекомоядных птиц, прилетающих по весне на гнездовья. С наступлением золотой поры - осени далеко несется рев тугайного оленя - хангула, вызывающего соперника на поединок. С наступлением темноты на охоту выходит камышовый кот-хаус, следом шумной гурьбой отправляются на кормежку кабаны. Осторожно ступая, по звериной тропе крадется к добыче лисица, дружным воем извещают о начале охоты шакалы и волки.

Забрав одну треть амударьинской воды многоводной рекой бежит по впадине Келифского Узбоя в глубь Южных Каракумов Каракумский канал. На всем 1500-километровом пути до Красноводска на канале построены водохранилища. В результате большой фильтрации воды сквозь песчаные стенки канала вдоль него образовались камышистые озера, в которых водятся разные виды рыб, гнездятся утки, цапли, большая и малая выпи.

Западную и юго-западную часть Туркестана (от полуострова Мангышлак до Атрека) омывают седые волны Каспия, уникального творения природы. За последнюю тысячу лет уровень Каспийского моря несколько раз поднимался и опускался. В начале 30-х годов 20 века уровень моря стал заметно понижаться. Сказалось глобальное потепление климата, вызвавшее уменьшение стока рек. В целях предотвращения усыхания моря на единственном в мире морском проливе Кара-Богаз-Гол ("Черная пасть") в 1980 г. была построена плотина. Однако с 1983 г. из-за увеличения стока рек, впадающих в Каспий, началось повышение уровня моря, которое достигло в последнее время 2 метров. Когда-то возвышавшиеся над водой обжитые острова и полуострова стали быстро затопляться, поэтому в 1992 г. было решено разрушить плотину на проливе и дать ход морской воде в залив Кара-Богаз-Гол.

Подводные луга моря из прибрежных водорослей, в которых размножается множество микроорганизмов, служащих кормом для рыб, привлекают к себе из Средиземноморья на гнездовья пеликанов, фламинго, желтых цапель, султанскую курочку, чаек. С наступлением холодов сюда на сытую зимовку устремляются с севера многочисленные стаи птиц. День и ночь над Красноводском стоит гвалт от кормящихся на мелководье розовых фламинго, лебедей, белых и серых гусей, казарок и множества уток, застилающих разноцветным ковром морские просторы. В отдельные морозные зимы прибрежные мелководья покрываются ледяным панцирем, наступает самое тяжелое время года для зимующих птиц. Голод гонит их на окраины прибрежных городов, рыбацких поселков, где обессилевших пернатых подкармливают люди.

В прибрежных водах Каспия обитает азовская кефаль, камбала и несколько разновидностей сельди. Нагуливают жир осетровые: стерлядь, севрюга, осетр, шип. На мелководьях жируют каспийский лосось и белорыбица. В тихих морских бухтах и лагунах после охоты за рыбой отлеживается на песчаных косах и островках группами и в одиночку морской зверь - каспийский тюлень. С наступлением первых зимних дней тюлени покидают прибрежные воды восточной части Каспийского моря и плывут в северную, где среди торосистых льдов у них появляется потомство.